珠海市斗门区河口渔业研究所位于珠海国家农业科技园区内，是由斗门区人民政府联合中国水产科学研究院 院地共建 的地方公益性科研机构。在地方各级领导和科研高校专家学者们的大力倡导和支持下，本研究所联合渔业骨干企业、政府部门、国内权威研究院所，通过优势互补、联合开发、利益共享、风险共担的技术创新模式，有效突破河口渔业产业重大共性技术难题，提升珠江流域河口渔业核心竞争力，打造国内领先的河口渔业 产学研科技平台 。
研究所办公场所占地面积300m2，目前与斗门区海洋渔业局合署办公。研究所现有综合性基地一处，位于珠海市斗门区鹤洲北农垦区内，其中生产设施有综合实验室、孵化车间、底栖动物繁育室、河口渔业种质保护与繁育基地、河口渔业中试基地、台湾良种转移基地。综合实验室建筑面积1000m2，现有检测仪器设备资产200万元，设备种类较齐全，可以满足常规水质检测、病害检测、微生物培养、养殖水产品的样品长期冷冻保存等各项实验要求;孵化车间面积500m2，300m3水体，配备有加热及制冷设备;种质保护与繁育池塘9口，中试池塘6口，良种转移试点池塘8口，自主养殖示范面积160亩，辐射周边示范养殖面积2万亩。本研究所的现有基础条件，既可保证自身的科研探索，又能满足与各科研院所高校的项目合作和新技术的引进推广，同时也可以为周边2万亩示范养殖区提供免费的技术服务，社会公益功能显著。
目前，本研究所有高级职称者2人，中级职称5人，均为水产相关专业本科及以上学历，同时均具有至少3年以上水产行业一线工作经验。2012年成立以来，本所与相关单位联合承担省级项目一项，市级项目一项。本研究所还与中国水产科学研究院、中国海洋大学、中山大学、厦门大学以及广东海洋大学有深入的科研合作。中国海洋大学的温海深教授、张美昭教授，厦门大学的洪万树教授，广东海洋大学的吴琴瑟教授等均曾在本研究所进行驻点技术实验和试点，开展了海鲈种苗繁育、白鸽鱼全人工育苗、海鲈麻醉技术研究等多项产学研工作。本研究所还与珠海水产行业骨干企业如鲲盛、海源、之山、嘉宜水产和长丰种苗场等联手，构建河口渔业技术产学研试点和推广平台。
珠海市斗门区河口渔业研究所每年由斗门区人民政府固定拨款经费150万元。由中国水产科学研究院提供技术支撑和科研设备，派驻科技团队，针对斗门区河口渔业特点，进行技术支撑和转化、课题科技示范、平台建设和维护等。河口渔业研究所联合斗门区内5家河口渔业示范基地，从事中试性和产业化课题示范。目前，珠海市斗门区河口渔业研究所是 中国水产科学研究院河口渔业创新与示范基地 、 中国水产科学研究院南海水产研究所河口渔业中心 、 中国海洋大学水产学科教学科研斗门基地 和 斗门区院士工作站 。 本研究所正在申请 广东省院士工作站 ，并获得雷霁霖院士和林浩然院士的肯定和大力支持，同时本研究所还与中国水产科学研究院南海水产研究所、中国海洋大学、厦门大学、中山大学、广东海洋大学等科研院所的相关领域专家学者有广泛的项目合作与科研交流，科研技术资源丰富。
